До 2014 року загін базувався в Севастополі. Його бійці брали участь у міжнародних навчаннях «Сі Бриз» і в антипіратських операціях «Океанський щит» та «Аталанта». Під час російського захоплення Криму на материк вийшли лише семеро з близько вісімдесяти військовослужбовців, і загін довелося відтворювати фактично заново.
Відновлений підрозділ залучали до бойових дій на сході України. У січні 2018 року він відпрацьовував у морському порту виявлення й знешкодження підводного вибухового пристрою та звільнення заручника з борту судна.