З перших днів антитерористичної операції у 2014 році військовослужбовці центру виконували спеціальні завдання на сході України.
У липні 2017 року бійці центру брали участь у міжнародних навчаннях Flaming Sword у Литві. У червні 2019 року підрозділ центру першим серед підрозділів країн, що не є членами НАТО, пройшов сертифікацію як підрозділ сил спеціальних операцій для Сил швидкого реагування НАТО.
Після повномасштабного вторгнення у 2022 році підрозділи центру брали участь в обороні та звільненні Київщини, зокрема Бучі, Гостомеля та Бородянки, а восени 2022 року — в осінньому контрнаступі. Згодом оператори центру діяли на Херсонщині та Запоріжжі, а у 2024 році — у Курській області.