Протягом першого десятиліття військовослужбовці комендатури забезпечували польоти під час повітряних навчань і брали участь у ліквідації наслідків стихійного лиха. Окремі військовослужбовці частини виконували завдання у складі миротворчих сил у Придністровському регіоні Республіки Молдова та в Демократичній Республіці Конго.
Під час АТО військовослужбовці комендатури виконували бойові завдання на позиції «Зеніт» у районі Донецького аеропорту, а також у Донецькій і Луганській областях у складі десантно-штурмових військ. Після початку повномасштабного вторгнення 24 лютого 2022 року особовий склад продовжив виконувати завдання за призначенням попри ракетні удари по аеродрому. Військовослужбовці частини воювали також у складі Зведеної стрілецької бригади Повітряних сил.